En 1881, la municipalité de Lons-le-Saunier réinvestit le projet abandonné à plusieurs reprises d’élever un monument à la gloire de l’enfant du pays, Rouget de Lisle, auteur de la Marseillaise, chant élevé au rang d’hymne national depuis 1879. C’est le sculpteur alsacien Auguste Bartholdi, dont les travaux consacrés aux grands hommes de la patrie ont établi la réputation, qui est désigné. La maquette du monument, piédestal et statue, est entrée au musée quelques semaines après que le sculpteur ait défendu son projet devant le conseil municipal. Certains détails ont par la suite été modifiés, comme en témoignent d’autres esquisses du projet conservées au musée, le vêtement, les attributs situés aux pieds du personnage, mais l’esprit général de l’ensemble, inspiré du tableau d’Isodore Pils peint en 1848, a été conservé. La statue en bronze, exécutée par la fonderie Thiébaut frères, inaugurée en 1882 sur la place de la Chevalerie sous le parrainage de Victor Hugo, est toujours visible aujourd’hui au centre-ville.